许多水生植物种植后大面积，达不到预期效果的重要原因就是水位问题。
种植施工作业时，由于项目尚未竣工、水体没有完全蓄水或在春天枯水期水位偏低。施工人员通常认为水生植物不能离开水，水深一点浅一点无所谓，常把水生植物种植在设计等深线以下或等高线以上。
到了蓄水时或者水位涨到常水位，由于种的太深，挺水植物被“淹死”，浮叶植物叶子浮不出水面被“闷死”，沉水植物因水深光照过弱而“饿死”；或由于种的离常水位线高出许多，挺水植物被“旱死”常水位线是水生植物的生命线，在实际施工作业时对常水位线要给与足够的重视。
沉水植物可整株沉没于水中，只在花期将花及少部分茎叶伸出水面，无根或根系不发达。此类水生植物以观叶为主；花通常较小，花期较短，但开花时亦具有一定的观赏价值。各个的形态、结构等都是典型的水生性的，不具有抑制水分蒸发的结构，甚至在水分不足时，大量供应苦草批发，细胞很快就会出现脱水现象，这些都是其生长所依赖的水环境造就的特殊的生理构造。在水中弱光的条件下也能生长，植株各部位均能吸收养分，可净化水体。
水深对苦草生长的影响
沉水植物生长受水深的影响较大，生态系统恢复重建时，需根据水深配置不同的植物。研究表明水深梯度的变化对苦草的叶片生长及叶绿素含量有影响，但对生物量的分配作用不明显。比较几个水深梯度，发现在100~140 cm的水深范围苦草生长较好。不同沉水植物的耐受水深能力各不相同。其中，苦草耐受水深范围广， 在2 m水深以内生长---；而轮叶黑藻在0.5 m水水深内相对生长率，深耐受水深为1.5 m；金鱼藻仅在表层水中生长情况，1.5 m水深时基本。
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